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STR分型检测
    发布时间: 2016-03-28 21:05    
短串联重复序列(short tandem repeat,STR),也称微卫星DNA(micro satellite DNA),是指以少数几个核苷酸(多数为2-4个)为单位多次串联重复的DNA序列。由于重复单位及重复次数不同,使其分布具有很大的差异性,构成了STR的遗传多态性,并按孟德尔规律呈共显性遗传。由于STR具有种属特异性、适合于复合扩增、适合于降解、微量样品的检测等特性,使其在人类基因组遗传图谱的制作,种质鉴定,亲缘关系分析,法医学个体识别和亲权鉴定,筛选目的基因和基因诊断,器官移植,基因定位等领域都得到了**的应用。

  STR 作为遗传标记有以下优点:
 1.片段短,可以复合扩增,提高识别能力  

  2.多态性程度高,等位基因多,鉴别能力强(在每个STR 位点上, 多有几个或几十个等位片段)  

  3.适合于陈旧的样品,检测能力强  

  4.灵敏度高,有利于微量样品的检测  

  5.检测手段易于自动化、***、重复性*(常用的检测技术PCR 扩增, 凝胶电泳分型, 或测序仪自动分型)  

  服务特色:  

  1.ABI 3730xl遗传分析系统  

  2.自有多种荧光探针合成,缩短时间,提**率,**结果准确性  

  3.ABI GeneScan 3.0或 GeneMapper 4.0软件自动完成数据获取和处理分析,为后期结果分析提供可靠数据  

STR分析方法原理:
   通过检索DNA数据库或构建基因组文库,获得微卫星序列。由于微卫星两侧的序列在同一物种间是高度保守的,据此可设计荧光标记引物,扩增同一物种甚至不同物种其它基因型的微卫星片段得到多个相差几bp的片段,将扩增产物和内标混合,经ABI测序仪跑胶后,根据峰的个数确定对应样本STR等位基因杂合或者纯合。多个位点的多重PCR扩增,可通过使用几种荧光标记来区分,ABI测序仪对PCR扩增后,荧光颜色不同的DNA片段的峰进行长度检测,DNA片段与内标比较确定长度。*后与以同样方式确定的等位基因Ladder比较,得到未知样本的PCR产物片段分型。
 
 STR分析原理示意图:
 
 

   

 
 

  服务内容描述  

  1.客户提供特异性扩增的PCR产物及PCR电泳图,PCR产物上机检测,软件自动读取实验结果,提供原始实验结果及简单结果分析  

  2.客户实验方案的确定。帮助客户选取要做STR位点,根据STR位点信息设计引物、PCR预实验确定*佳实验条件,**PCR产物的特异性。荧光修饰引物合成,STR检测,简单数据分析,完成STR检测的全套服务。
 
 实验流程
 STR位点序列的获取  基因组DNA提取 →  荧光标记引物设计、合成 → 多重PCR扩增  毛细管电泳检测  Genemapper软件收集、分析数据
 
 客户方提供  

  STR位点信息:
 STR位点上下游各250bp序列,重复单位个数相关信息  

  STR分析样品的要求:  

  1.若所送样品为基因组DNA 或质粒DNA ,样品要求:DNA 浓度≥20ng/ul,体积≥10ul(若位点数较多,则按1ul/位点准备),纯度 OD 260/280 在1.7~1.9 之间。如果客户要求提供样品纯化服务,我们将收取纯化费。  

  2.若样品为血样,样本要求:血液样品,体积大于 500ul,用EDTA抗凝,送样过程中请注意保持低温,防止DNA降解;血斑样品,9-25mm2 大小的血斑两个以上。对每个血样或血斑样本将收取DNA 提取费。若分型样品为细胞、组织样品,样本要求:细胞≥105,组织≥100mg,黄豆大小。  

  3.客户在寄送样品的时候,应在送样包裹中放置足量的冰袋,以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。请在每次寄出样品后及时与本公司分型部联系,可以E-mail 或者传真的方式告知样品的详细信息,以便收到样品后能及时与您进行联系确认。
 
 检测周期
 常规检测任务3周内完成,具体时间根据STR位点及样本数而定。
 
 我们提交结果  

  1.Genemapper分析图谱(PDF格式)及原始fsa格式峰型图  

  2.各峰的相对分子量等具体信息(Excel格式)  

  3.完整实验报告(包括引物序列、扩增反应体系,实验步骤等)  

  4.数据分析软件及使用说明  

   

  

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